《暂行办法》规定，总包单位应当在工程施工合同签订之日起30日内开立专用账户，并与建设单位、开户银行签订资金管理三方协议。专用账户名称为总包单位名称加工程建设项目名称后加“农民工工资专用账户”。同时，建设单位与总包单位订立书面工程施工合同时，应当约定工程款计量周期和工程款进度结算办法、建设单位拨付人工费用的周期和拨付日期以及人工费用的数额或者占工程款的比例，且应当满足农民工工资按时足额支付的要求。此外，总包单位有2个及以上工程建设项目的，可开立新的专用账户，也可在符合项目所在地监管要求的情况下，在已有专用账户下按项目分别管理。
工程完工、总包单位或者开户银行发生变更需要撤销专用账户的，总包单位将本工程建设项目无拖欠农民工工资情况公示30日，并向项目所在地人力资源社会保障行政部门、相关行业工程建设主管部门出具无拖欠农民工工资承诺书。但工程建设项目存在以下情况，总包单位不得向开户银行申请撤销专用账户：尚有拖欠农民工工资案件正在处理的；农民工因工资支付问题正在申请劳动争议仲裁或者向人民法院提起诉讼的；其他拖欠农民工工资的情形。
为切实保障专款上用，《暂行辦法》一方面规范要求搭建企业计量单位开展对总包企业计量单位公司设立、公司上用账号情形的辅导，还明确化进行开户证券公司不应将上用账号资源转进除本新项目老百姓工本身证券公司账号本身的账号，不应为上用账号保证現金取现和其余转帐核算精准服务。为了保障人工费用的及时拨付，《暂行办法》要求建设单位应当按工程施工合同约定的数额或者比例等，按时将人工费用拨付到总包单位专用账户。人工费用拨付周期不得超过1个月。若出现未按约定拨付人工费用等情况的，开户银行应当通知总包单位，由总包单位报告项目所在地人力资源社会保障行政部门和相关行业工程建设主管部门，相关部门应当纳入欠薪预警并及时进行处置。若建设单位已经按约定足额向专用账户拨付资金，但总包单位依然拖欠农民工工资的，建设单位应及时报告有关部门。
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